报告题目:eigengwas:非监督的群体基因组选择位点扫描算法
报告人:陈国波,副研究员,临床研究所、浙江省人民医院
报告时间:2021年5月14日 15:30——16:30
报告地点:学11-304
报告摘要:
随着高通量测序技术的普及,群体基因组数据大量出现,伴随而来的问题是数据缺乏合理分类。利用群体漂变原理和矩阵特征根的对称关系,我们提出了基于群体内蕴结构的全基因组扫描算法:eigengwas。本研究见展示从理论构建到算法实现的整个过程,以及在一些实际数据分析中的成功实例。另外,随着样本量从最几年前的几百例进化到几千、甚至几十万例,eigengwas从统计计算到程序实现都面临一系列挑战和计算内核的整体提升。
主讲人简介:
陈国波,2009年浙江大学数量遗传学博士,2011~2015年澳大利亚昆士兰大学大脑研究所博士后。2017年至今,浙江省人民医院临床医学研究所副研究员。从事统计遗传学研究,在nature,lancet,am j hum genet,hum mol genet,bioinformatics,mol ecology等杂志发表论文40余篇,google scholar引用超3200次,h-index 19。
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信息工程学院
2021年5月12日